1995年，在出访美国时首次接触到因特网，回国后创办了网站“中国的黄页”。1997年，加入了中国外经贸部，负责开发其官方站点及中国产品网上交易市场。
1999年，正式辞去公职，创办阿里巴巴网站，开拓电子商务应用，尤其是B2B业务。目前，阿里巴巴是全球最大的B2B网站之一。
阿里巴巴网站成功，使马云多次获邀到全球著名高等学府讲学，当中包括宾夕法尼亚大学的沃顿商学院、麻省理工大学、哈佛大学等。
作为中国电子商务的先驱，马云创办的阿里巴巴集团(Alibaba Group)是中国最大的电子商务公司，拥有两家全世界最受欢迎的网站：淘宝(Taobao)和阿里巴巴网(Alibaba.com)。
马云为阿里巴巴集团的主要创办人，自一九九九年成立以来一直出任阿里巴巴集团的董事局主席及行政总裁。马云先生负责阿里巴巴集团及本公司的整体策略及方针。
