魅蓝S6搭载一颗三星Exynos 7872处理器，分别为两颗* Cortex A73 2.0GHz大核心和四颗* Cortex A53 1.6GHz小核心。两颗A73大核心带来强劲性能，而四颗小核心则在日常轻量使用的时候更加省电。
那么，魅蓝S6和魅蓝Note6有什么区别呢？
电池容量方面，魅蓝Note6内置的是4000mAh大容量电池，而魅蓝S6只有3000mAh。鉴于两者屏幕大小相差不大，处理器均为14nm低功耗，并且均支持快充。显然，就续航而言，电池容量明显更大的魅蓝Note6优势明显。
魅蓝S6是魅族首款全面屏手机，正面配备现在流行的18:9全面屏，并且由于全面屏屏占比更高，使得屏幕更大的魅蓝S6机身尺寸反而比魅蓝Note6小，屏幕也更显修长一些。
背面方面，魅蓝S6相比魅蓝Note6也有所改进，它采用了时下更流行的U型隐藏式天线设计，相比Note6背面更显简约一些。
侧面方面，魅蓝S6是国产手机中，首款采用侧面指纹设计的手机，开启了全面屏侧面指纹创新设计，增强了机身辨识度。而魅蓝Note6为传统正面指纹识别设计，操作上显得更符合时下主流。
总的来说，魅蓝S6有全面屏+创新侧面指纹设计，并且机身尺寸更小、更薄，就颜值来说，无疑比魅蓝Note6成熟了不少，外观更为漂亮。
