李密失败后，投降王世充，因不满王的为人，于619年(唐高祖武德二年)同程知节等人一起投唐，被分配到秦王李世民帐下。参加了李世民的历次征战，每战必先，常于万军之中取敌将首级。626年(武德九年)，未参与玄武门之变，但事后被封为左武卫大将军。
秦琼晚年因历次作战负伤太多而疾病缠身，常对人说：“吾少长戎马，所经二百余阵，屡中重疮。计吾前后出血亦数斛矣，安得不病乎?”贞观十二年(638年)，在任徐州都督时去世，陪葬昭陵。贞观十三年(639年)，秦琼被追封为胡国公。贞观十七年(643年)，秦琼与长孙无忌等人被图形凌烟阁，封为唐开国二十四功臣之一。
如此一功臣，为何排名倒数第一呢？我个人认为，是《隋唐演义》让我们看高了他。我个人认为，如果叔宝真的没有参加事变，除了调动原因外，很可能是他也像李绩李靖一样持中立态度，为什么呢?因为他并不会单纯的像演义里那样是为了李世民而投唐，当时的皇帝是李渊，而李渊对他恩遇有加。
叔宝的经历应该使他不愿意去做让皇上亲子相残的事的。也许因此李世民对秦琼的信任从此有所保留。秦琼的历史记载不多，不过透过文字记载，呈现在我眼前的是一个“志节完整”——来护儿评语，勇猛无畏，胸怀大志，有气节，经历坎坷，傲视天下勇者的豪杰！在秦琼去世五年后，唐太宗还能记住他，并将其名列凌烟阁二十四功臣之一已实属可贵。
