日本近年开发研制了一系列深层海水食品，如深层海水豆腐、酱油、果汁、酒类、瓶装水、豆浆、果冻、糕点以及天然盐等产品陆续登场。
由于深层海水清洁少菌，且所含微量元素和矿物质几乎已到均衡状态，因而用深层海水生产的食品日益受到欢迎。
深层海水还可用于制造药物和保健品。美国在20世纪70年代起就用深层海水成功地研制出抗癌药物，甚至将深层海水去涩去盐处理作为保健饮料。
日本除了利用深层海水大量培养微细藻类作为健康食品的原料外，还建造了许多深层海水浴室，进行深层海水浴疗，吸引了不少观光游客。
深层海水用于水产养殖业，也是独特优势。日本抽取深层海水用以人工饲养某些鱼虾类，大大提高了鱼虾成活率。除了用深层海水大量生产龙虾和虾苗，还养殖名贵的鳟鱼、鲆鱼和海豚等，已取得了良好成效。
