有学者认为精绝国消失主要原因是环境恶化，也有学者认为是战争。有些学者否定了这两种看法，却又无法解释精绝国的神秘消失。
环境恶化论的持有者认为，精绝国从尼雅河通过人工渠引水入注，尼雅河最终还是断流了，原先"精绝国"的地方失去了水源，居民无法耕种与生活，最后只好离开这里，迁移到其他地方。
认为精绝国消失于战争的学者：东汉末年，汉朝国力衰弱，中原处于分裂与战乱，西域出现政治真空，此时西域发生各小国和部族相互侵吞的战乱也随之而来，所以精绝被他国或更强悍的部落毁灭也是可能的。
在汉朝时期，精绝国称得上是西域三十六国中非常强大，繁荣的国度，至于精绝古国的消失之谜，至今仍然没有任何的有力说法。
