端午时节及节后，气候炎热，蝇虫飞动，毒气上升，疫病萌发。古人认为人是吃五谷杂粮生百病的，而病从口入，多为邪杂之气，经口鼻吸入。
人们在长期同各种病魔斗争过程中，发现饮雄黄酒、佩戴香包能驱邪解毒，自有它的医理。《清嘉录》记载：“研雄黄末，屑蒲根，和酒饮之，谓之雄黄酒。”即在酒里加上雄黄。雄黄，橘红色，可入药解病毒。
另一方面是有解毒驱蛇的作用。端午节时，气候温和，正是各种昆虫和蛇类繁殖、活动猖獗的时候。
而小孩子又喜欢漫山遍野地乱跑，如果在他们身上抹点雄黄，蛇一闻到雄黄的气味就会自动逃跑，这样就避免了蛇伤的危险，所以在儿童身上抹一点雄黄酒，是有一定的科学道理的。
