也许有人会这样认为：树化玉就是玉之中的一种，玉只是一个极大的概念，但实质上，树化玉与玉是有着本质的区别。
第一，从外形看，它是段树木，它保持了树木所有的外形特征，它向人们所展示的树皮、树杈、树节、树结、木材纤维，无不保存了树木的原有形态。
这种大自然流露出来的朴实、厚重、沧桑的外形是普通璞玉所没有的，璞玉向我们展示的往往只是圆滑、随意、鹅卵石或不规则石块般的外表。
第二，从剖面形状看，它首先是一段树木。它清晰完整地保持了树木原有的年轮、纹理、蛀洞，是古代树木内质形态的完整保留。
通过显微镜，人们甚至还可发现树木韧皮组织形成的层细胞、细胞壁、输水导管的形状痕迹。而玉往往是一块排列整齐、结构极为单一的矿石。它虽然也有纹理，但这种纹理是自然产生的，具有很强的随意性，主要价值体现在供人欣赏。
第三，从用途上看，首先，树化玉是大自然形成的植物化石，是一部研究远古气象、其他生物和地理资料的书籍，有着珍贵的考古和科研价值。
其次，在工艺上树化玉不仅可以制作雕饰、挂件、摆件等小型装饰品，还可制作大型雕件。最可贵的是它的奇特，人们往往不加修饰直接将它作为庭院的点缀，或者作为吉祥安宁的象征供在家中作为镇宅之宝石。
而玉石很少有科考价值，一般只能雕琢成小摆件、首饰、挂件等小件装饰品。人们在欣赏它漂亮质地的同时，主要是欣赏它的雕琢工艺。
