长坂之后，本书上直接转到刘备入蜀，而赵云则被留在荆州，关于赵云在赤壁大战以及随后的荆州攻略战中的表现如何，只字未提。倒是裴注所引的赵云别传中记载着赵云在荆州攻略战后受封偏将军，领桂阳太守，刘备入蜀时他出任留营司马，并随后与张飞一起“横江截阿斗”。但该别传以史料而论并不严谨，所记载的多是与赵云相关的逸事，真实性有待商榷。虽然前文有几处引用了别传中的记述，但在涉及到赵云所立功绩，受封官职等重大事件上，还是依从本书。
刘备在蜀中的攻略中遇到顽强的抵抗，损失惨重，陷入进退不能的窘境，只得急招诸葛亮率领张飞、赵云增援，此时，赵云在刘备集团中的地位已经发生了改变，正从单纯的贴身警卫而过渡为上阵搏杀的武将。乍看之下，这与文章前面的观点有所矛盾，但其实不然。一方面，此时，刘备已经有了自己的地盘，不再像以前寄人篱下时需要时时刻刻防备他人的暗害；另一方面，赤壁战后刘备势力急剧扩充，而身边旧部下人数太少，新归附的荆州人士又不放心将兵权交付给他们。相比之下，赵云的忠诚是毫无疑问的，即使缺乏统兵的能力，但他的武勇始终是影响战斗结局的一个重大因素。因此，此后赵云在大部分情况下都是或领兵作后备，或在他人的指挥下参加战斗。以入蜀为例，赵云先是在诸葛亮率领下“溯江西上”，到江州后又领偏师“从外水上江阳，与亮会于成都”，避开了与刘璋主力的正面交锋，始终没有独自与刘璋大军交战。蜀中平定后，赵云以援军之功受封翊军将军。
这之后本书上对赵云的记载又有很长时间的阙如，而赵云别传中倒是记载汉中战役时赵云与黄忠曾共同作战，刘备东征伐吴时赵云被留在江州为刘备后援等事。单以史料而言，赵云在汉中时遇曹操大军，在营地被包围的情况下以“空城计”吓退曹操一事的真实性相当可疑；而刘备东征前力谏刘备先魏后吴，以至于被刘备留在江州一事则较有可能。
建兴元年，刘禅登基后大行封赏，赵云受封中护军、征南将军，永昌亭侯等职衔，不久又晋升为镇东将军。这些封赏，应该和当时赵云在蜀汉集团中的地位密不可分。蜀汉政权的权力其实是在原从集团、荆州集团和益州集团三者之间共同分配的。刘备死后，原从集团中的元老级人物只剩下赵云一人而已，而新皇帝登基后，为了安定人心，对三个集团的代表进行赏赐也在常理之中。
原从集团的代表人物，赵云这一特殊的身份在为他带来了荣誉和地位的同时，也意味着他要卷入复杂的政治斗争之中。蜀汉军制，分为内军和外军两种，内军由皇帝亲自统帅，在建兴年间，基本上为诸葛亮所掌控；外军是刘备推行都督制的产物，其代表为驻汉中的魏延以及驻永安的李严。赵云虽然身为镇东将军，但他并不属于外军之列，没有都督的官职就是最好的证据。当然，如依本文的一贯论点，赵云自身缺乏统兵才能，自然不会受封重要的都督职位。以此推论，赵云应该属于内军编制。而这也符合本书记载的“五年，随诸葛亮驻汉中”，即与诸葛亮同以内军将领身份北伐。而正是这次北伐，标志着赵云在内部权力斗争中的全面落败，也意味着他政治生命的结束。
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