为了政治的稳固，由太皇太后孝庄做主，将辅政大臣索尼的孙女，领侍卫内大臣喀布拉之女赫舍里氏许给康熙为妻，康熙四年大婚。时年皇帝十二岁，皇后十三岁。
第一任皇后是康熙帝的发妻，史称孝诚仁皇后。这位皇后与康熙感情甚笃，两人成婚四年后，生皇二子承佑，不幸的是这个孩子长到四岁就早夭了。
康熙十三年，生生皇六子胤礽，这个皇六子就是被康熙复立复废的皇太子。胤礽出生不久，赫舍里氏就在产房去世，死的时候年仅二十二岁。谥曰：孝诚恭肃正惠安和俪天襄圣仁皇后。至乾隆、嘉庆年间，屡加溢号，全部溢号为：孝诚恭肃正惠安和淑懿恪敏俪天襄圣仁皇后。
康熙的第二任皇后为辅政大臣一等公遏必隆之女，钮祜禄氏，满洲镶黄旗人，史称孝昭仁皇后。康熙十六年册封其为皇后，这位钮祜禄氏也是福薄，册封皇后不到半年就去世了。经雍正、乾隆、嘉庆三朝，累加谥号，全称为：孝昭静淑明惠正和安裕端穆钦天顺圣仁皇后。
康熙的第三任皇后是领侍卫内大臣佟国维之女，佟佳氏，满洲镶黄旗人，史称孝懿仁皇后。佟佳氏是康熙的表姐，即康熙生母孝康章皇后的亲侄女。
这位皇后更惨，当了一天的皇后就崩了。她初始是被康熙册封为皇贵妃的，后来佟佳氏病重，许是想要以皇后之称镇住她的性命。
因此在病重弥留之际，康熙帝谕礼部：“奉皇太后慈谕，皇贵妃佟氏，孝敬成性，淑仪素著，鞠育众子备极恩勤，今忽尔遘疾，势在濒危，于心深为轸惜，应即立为皇后，以示崇褒，钦此。前者九卿诸臣，屡以册立中宫为请，朕心少有思维，迁延未许。今抵遵慈命，立皇贵妃佟氏为皇后，应行典礼，尔部即议以闻。”。
初九被册为皇后，初十就去世了，所以只当了一天皇后。雍正、乾隆、嘉庆间，累加谥：孝懿温诚端仁宪穆和洛慈惠奉天佐圣仁皇后。 这位皇后死后十多年，康熙再没有立过新后。用他自己的说法就是自己命硬，克父克母，克妻克子。
康熙的最后一任皇后不是康熙册封的，而是由康熙的继任者雍正皇帝册封的。这第四任皇后是雍正的生母孝恭仁皇后乌雅氏。这位皇后于雍正元年去世，终年六十四岁。全部谥号为：孝恭宣惠温肃定裕慈纯钦穆赞天承圣仁皇后。
在这么多任妻子中，康熙最爱的应当是他的发妻，孝诚仁皇后赫舍里氏。虽然这两人是因为政治原因才走到一起的，但是从十二三岁开始，两人就在偌大的皇宫作伴。兼具有共同的敌人鳌拜，所以两人之间的情分，不是一两句话能说的清的。
后来皇后产后死去，康熙悲痛不已，为其停朝五日，从五月初五开始，康熙每天都会去梓宫前举哀。诸王以下的文武官员及公主王妃以下的八旗二品命归人等，俱齐集举哀。
二十七号康熙亲自将皇后送到了巩华城，此后几年看望无数。十四年去24次，十五年去15次，十六年的除夕也去看望了赫舍里皇后。朝鲜使臣向其国王报告说：“清皇不恤国事……”
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