节目从策划到播出近半年时间，为了找这些“神奇的孩子”，前期节目组广泛撒网，对上万个孩子进行了挑选：“包括各种教育机构、学校啊，还有网上搜索，以及从以前结识的关系里。
挑选孩子的标准首先要可爱纯真非常自然、真性情，在选择孩子的才能时，尽量的选择各种各样，甚至于有些出乎意料才能的小孩。更多是对孩子和对他家庭的了解。我们并没有对他们有特别的辅导，而是主动去了解。在单位的录制时间以内，把他们最好的状态激发出来，是我们工作的重点。”
不设赛制
教育专家把关，重在说和秀
与以往选秀节目不同的是，这档以素人萌娃为主的真人秀没有竞争激烈的比赛，也没有技能高低的评选。不设评委，也不限制对错。每期节目中除了一群萌娃，一位主持人，还有三个作为嘉宾的“神奇三宝”，看点最终聚焦在孩子身上。
刘蕾表示，这样的设置就是为了给孩子一个单纯的“说”与“秀”的领域：“以前有个观点就是为社会培养人，现在很多独生子女实际上是在为自己培养人，我觉得你学钢琴好，学这个好。
但我们的宗旨就是尊重孩子的天性，尊重他们的好奇心，可能这些技能有用也可能没有用，但他们的创造性好奇心才是最难能可贵的一个部分，这是我们特别要保护的。”
湖南卫视为何在“寸土寸金”的黄金时段播放一档纯素人的节目，也令人好奇。对此刘蕾坦言：“其实我们台里一直想做一些差异化竞争，大家也知道，特别是周末黄金档，体量越来越大，砸的钱越来越多，明星咖位没有最大只有更大，这种竞争让人确实不堪重负。再者现在满屏幕大制作的竞争之间，有没有以素人本身的魅力去竞争的可能。”
因此在做节目时，刘蕾一直请教育专家来把关。“我们肯定有很多问题要去避免。一个主流媒体怎样引导怎样传达正确的教育理念、价值观，这个是非常重要的，也是我们的一个责任。
我们做这个节目更多强调的是既好看又有意义，避免负面影响，全面考虑我们的选材会对观看的家庭带去什么样的影响。可能真的存在那些天赋异禀的孩子，但是对于家长来说存在 不安全感 ，我们也会舍弃。”据介绍，《神奇的孩子》里出镜的萌娃最小2岁，最大的孩子13岁，将有60多个萌娃登上舞台。
