苏有朋透露，从最初的“1.0版”到开机前的“10.3版”，剧本一共改了一百多遍，其间还举办了好几次剧本围读会，找人来挑刺。“很多细节都要前后呼应，尽量做到逻辑上没有破绽。”
日版最忠于原著并增加了女警与物理学家的感情线，韩版则强调了嫌疑人的爱情故事，而中国版的创新点则在于“讲故事的角度”，“石泓献身的动机纯粹而感人，而我想用另一个角度来看这件事。”
“以石泓的智商应该可以有更好的解决方式，我试图让大家看到他处理这件事时比较血腥残忍的一面，让大家感受这件事的两面性。”这番努力没白费，日前剧组公开了东野圭吾的亲笔信。
信中写道“看到才华横溢的你们没有拘泥于原著，而是富于创造性的改编，我感到欣慰而有趣”，并希望电影能够“震撼世界，震撼你们”。为了不辜负期望，据说在拍摄期间，苏有朋几乎到了着魔的的地步。
在剧组人员的印象中，《嫌疑人x的献身》的片场是压抑的。“因为导演希望片场保持一种安静的氛围，所以要求所有工作人员不要大声说话，不能大声笑，交流都要很小声，整个片场都是很安静的。”
