9年前因为一桩“事故”让庄恕和妹妹被迫分开，时间已经过去了29年，长大后的庄恕与妹妹都变了样子，根本不可能认出对方，更何况那时候妹妹才4岁。
庄恕表面冷峻深沉，怀着秘密回国在仁合医院当胸外科专家，也招惹到其他医院的眼红。不过庄恕并不理会这些，他只是想为母亲还原清白而已，况且当年的事故并没有想象中的那么简单，还出触及到医院内部人员的关系，所以掀起一番《外科风云》。
故事起源于多年前一场引发命案的“医疗事故”。一位抢救成功的车祸伤员却因突发药物过敏死亡,当晚责任护士张淑梅被质疑用错药导致病人死亡被迫离开岗位。
张淑梅八岁的儿子因不信别人对母亲疏忽致患者死亡的议论,打架被罚,耽误了接四岁的妹妹回家,导致妹妹被人贩子拐走。张淑梅因失女和“用药失误致人死亡”的指责精神逐渐恍惚,自杀身亡,而儿子也在外城投亲后下落不明。
美籍华裔外科专家庄恕（靳东饰）为追查30年前母亲张淑梅的事故真相找寻走失的妹妹来到新城仁和医院。当年死者的女儿陆晨曦（白百何饰），师傅博文（马少骅饰），成长为胸外科主治医生，却因屡次得罪胸外科主任扬帆（刘奕君饰），被调至急诊。
而庄恕屡次把技能过硬的陆晨曦重新带回胸外手术台。朝夕相处中，庄恕的医术让陆晨曦惊叹，对患者的周到考虑也让陆晨曦反思，二人渐生情愫，最终，庄恕找回了妹妹,也在陆晨曦的协助下还原了母亲当年事故的真相。
