按理说习武之人经常运动，身体应该不错，但李连杰年轻时拍过不少打戏，却因此落下病根。早年拍电影可不像现在用的是特技，大家都是真功夫上阵。
23岁时，他在拍摄电影《南北少林》过程中脊椎错位、背部肌肉严重拉伤，第五腰椎裂开。拍摄《黄飞鸿》期间，左脚脚踝严重折断，可摆成一百八十度。
拍摄电影《霍元甲》时，他从12尺高台坠落，受内伤；与秦爷水中对战，被刀砍伤手臂；与泰拳高手和大力士对戏时，手掌、胸部和背部受伤。
如果不是2004年马尔代夫发生海啸时他正好在现场，他可能就是值得哀怜的第31个明星，倒不是说那场海啸医治好了他的伤病，而是，它改变了他对死亡的态度。他减少了拍片量，成立了壹基金，和妻子商量，子女当中一定有一个是红十字会的志愿者。
李连杰因为患上了甲状腺亢进症。体重一度暴跌18磅，并透露因病面临无法正常的工作，病情到现在都时好时坏。更因为年轻时拍武打戏多次受伤，被医生告知：晚年很可能在轮椅上度过。大多数人只看到了他的成功，却没有看到他为了成功所付出的代价。
