这一点上，编剧显然颇费心思，第二部中的大反派魏德信（陈豪饰）是第一部中爆seed的父亲，而他的得力助手施嘉莉（宣萱饰）则是阿钉的生母，两人将上演一段“父母爱情”，而阿钉的生父是谁，为何阿钉是被三个“妈妈”抚养长大，则是更大的悬念。
与此同时，随着情节的发展，也顺便解释了首部中的一些存疑。比如欢喜哥是如何成为从卧底警察彻底沦为黑帮老大，而首部末尾删除欢喜哥警察档案的神秘人也随之揭晓。
比起第一部，《使徒行者2》显然更加电影化，每集会用一段充满暗示的引言开篇，与剧情紧密融合，颇有当年《无间道》的味道。
整部剧不仅风格更加硬朗犀利，情节更加紧凑，而且叙事结构更加精妙，打乱了时间线，采取了多线交叉叙事，环环相扣，逐渐拼凑出完整的故事。
