尽管如此，在口碑爆棚之外，也出现了不同意见。有人质疑“拍摄影响治疗”：“拍摄很难说会不会干扰到手术发挥，而病人以及家属在危急时刻面对镜头，会不会加剧他们的紧张感，都值得进一步考量。”
还有人认为纪录片有情感倾向失衡的问题：“体现了医生的辛劳、工作环境的严酷和治病救人的胸怀，试图借此呼吁对医生的尊重，但是医患关系不是一味理解医生就能解决的，有点肤浅，缺少反思力度。”
《人间世》最初就没想要做成单纯医疗的纪录片，更关注的是疾病和医疗行为发生之后的人的故事。
“把世界还原成一个人，把医院也还原成一个人，用人的喜怒哀乐让双方在某种程度上达成共识。 ”周全希望《人间世》是一个观察类、人文类的片子。
