故事从莫名出现在美国领土内的一块被检疫隔离的“X区域”展开。影片是一个关于“毁灭”的故事，定级为R级，会有不少血腥暴力以及惊悚恐怖的镜头。
很多原著书迷认为影片剧情和书的内容贴合度不高，很多情节细节上又有重大缺失。所以影片的导演对电影进行了一部分的删减，把那些的血腥镜头都删减掉了一些。
“X区域”图腾下鲜明的R级标志向观众们做出了“17岁以下未成年人需在监护人陪同下观看”的温馨提示。
《湮灭》采用非线性叙事，以一支勘探队进入未知“X区域”探险为主线，穿插女主角生物学家莉娜（娜塔莉·波特曼饰）的记忆闪回。
莉娜为调查发生在老公凯恩（奥斯卡·伊萨克饰）身上的难解事件，加入“遗落的南境”科考团深入“X区域”寻找答案，却遭遇了一系列突发危机。
