《莽荒纪》剧中有很多惊险刺激的莽荒大场面，所涉及到的特效和功夫打斗场面很多，大部分场景都是实景拍摄，转场了新疆、云南多地，还经历很多极端天气。
特效也是非常用心，目标比肩欧美，绝不做五毛特效。在定档发布会上，导演黄祖权打趣到牛骏峰戏里戏外都是全组人的开心果和捣蛋鬼，主演牛骏峰表示自己饰演的角色木子朔是一名傀儡师。
可以通过操纵傀儡让自己在打斗中“躺赢”，而许多操纵傀儡的动作戏份，也是需要通过特效完成，所以自己算是整个剧组特效最“贵”的角色，引得现场捧腹大笑。
据悉，《莽荒纪》的制作团队十分严谨，虽说是一部国产电视剧，却是电影骨子。该剧的特效团队多达400人，全剧共需20000多个特效镜头，单是特效分镜绘制已超400页，特效背景绿（蓝）幕使用过50000平方米。
