2017年1月18日，推出组合第二张EP专辑《BOOM！BOOM！BOOM！》；同年4月6日推出组合第三张EP专辑《I.F》；同年7月29日，与姐妹团SNH48、BEJ48和SHY48共同举办“我心翱翔”SNH48第四届偶像年度人气总选举演唱会。
AKB48和SNH48解除关系
2016年6月9日，日本女子偶像团体AKB48在其官方网站发布声明宣布，由于AKB48团体的上海姊妹组合SNH48在当地的运营涉嫌违约，因此将重新调整SNH48的运营。
声明中称，由于SNH48当地的运营网站涉嫌违约，因此决定对运营进行调整。同时，AKB48官网上有关SNH48的横幅和广告都也将一并撤下。此外，声明还宣布，对于在北京和广州分别成立BEJ48和GNZ48一事，日本公司并不知情，两个组合和AKB48团体没有任何关系。
对此，SNH48运营团队10日通过SNH48组合官网发布声明回应称，SNH48是一个完全独立、自主经营的中国本土化大型女子偶像团体和基于互联网思维的造星平台，运营方在和日本AKB48之跨国姐妹团体技术合作关系中，不存在所谓的违规行为，其所有日常运营活动一切照旧。
2016年4月20日，SNH48主体运营方宣布成立官方姐妹团BEJ48和GNZ48，同时公布了音乐内容原创战略，标志着SNH48已经全面走向原创道路，SNH48推出的一系列原创EP及原创剧场公演均获得了极其良好的口碑和反响，为SNH48在基础音乐方面的长期发展奠定了坚实的基础，未来也会坚持在音乐原创道路继续走下去。
