编剧何凌透露，这一季的剧本在人物上下足了功夫，从童年环境、原生家庭、成长背景、心理变化等多维度塑造人物，使得“清道夫”作为一名反派，呈现的是立体的而不是模式化的人物形象。
在主人公秦明的塑造上，增加了秦明初恋女友，美女法医陈诗羽两个女性角色，她们在剧中也会和秦明产生更多的碰撞，相信大家会看到一个更丰富的秦明。
对于“清道夫”这一神秘人物的真实身份，观众也是十分关注。编剧何凌坦言对于观众热衷的“猜凶手”行为并不担心，因为除了“清道夫”这一神秘人物的设置之外，剧中还有烧脑的刑事案件、缜密的法医解剖、复杂的人性揭露等精彩内容吸引大家。
《法医秦明2清道夫》延袭了第一季真实还原案件的风格，在原班制作班底的基础上，整体制作投资大幅度升级，更增加电影班底加持。
在故事方面，第二部力图为观众带来一场“内容为王”的故事大餐，除了更高的专业度之外，集与集之间不再是一个个独立的单元剧，而是警察破案和罪犯“清道夫”双线交叉、环环相扣，增加了剧集的关联性，更加重了悬疑成分，在发布的预告片可见一斑。
至于第一季被网友吐槽的“工作环境太好”“摸完尸体的手扶眼镜”等画面也不复存在，有观众认为，从秦明办公室、法医解剖室等场景真实性，到演员演绎的严谨性，都有了明显的提升。
