《金陵十二钗》的插曲都十分好听，其中一首《秦淮景》更是令人印象深刻。
本片有三首插曲给人留下深刻的印象。“十三钗”所唱的《秦淮景》、学生们所唱的教堂颂歌、日本军官所唱的童谣《故乡》。
1.《秦淮景》由陈其钢根据江苏民歌《无锡景》为素材改编、填词，苏州评弹的演唱方式尽显秦淮“十三钗”的风情与影片的地域特色。是影片的一大亮点。由十三钗们离开前集体唱出，堪称影片‘题眼’。
2.片中原汁原味的教堂颂歌合唱来自瑞典的阿尔麦纳合唱团，小提琴出自多次斩获格莱美以及奥斯卡电影原声音乐奖的美国小提琴家约舒亚·贝尔之手。
3.《故乡曲》流传为南京籍音乐人龚铭为家乡创作的《月光情》和《夜泊秦淮》等音乐作品的结合，具体日本到底有没有一首《故乡曲》就不知道了。
豆寇对浦生说：“等不打仗了，我弹琵琶，你拿棍，一起讨饭给你妈吃……”的桥段，令人伤感，触人泪腺，影片侧片体现了秦淮河风尘女子充满善良与爱心的一面，凸显救赎与被救赎的大主题，所有大事件都可以还原到细节，而细节永远都是最动人的。
书娟在教堂幻想十三钗着盛装唱《秦淮景》载歌载舞款款走来的那一幕情景，优雅展现金陵风月女子风华绝代的精彩，这精彩之外却令人含泪。
