2005年，王菲、李亚鹏在上海投资酒吧“VIPROOM”，该酒吧当时定位走高档路线，单是内部装修至少花费600万元人民币。由于过高的定位被称为“烧钱”酒吧，但正式开业后超高的人气，已使其成为上海最热门酒吧之一，据估算，每年仅酒吧收入就能进账百万元。李亚鹏曾透露合伙人是他的两位朋友，其中一人还是外籍人士，但据说王菲也有合股，约占四分之一。开在上海乌鲁木齐路上的VIPROOM酒吧，因为王菲和李亚鹏的投资，一度成为上海夜店中相当热闹的一家。
2006年5月，王菲产下小女儿，取名李嫣。7月两人带女儿去美国治疗兔唇，之后共同成立“嫣然基金会”，关注唇腭裂患儿。在12月26日的“嫣然慈善基金答谢会”上募集到1200万善款。
据了解，一般基金会都会从募捐得来的款项中拿出大约10%左右的金额进行投资，然后再用投资回报继续投入慈善事业。据知情人士透露，嫣然基金也是以这种模式进行操作，保证资金的良性循环，所以也不会为王菲夫妇增加额外负担。
2007年，王菲与那英等好友合伙在北京开设的发廊VAIRASALON，定价较高。剪一个普通男士头发就要人民币1500元，价钱会根据发型师的级数分等级。 该店聘请的是来自香港地区和法国的发型师，很多国内大牌明星经常光顾，如赵薇、章子怡、张信哲、苏有朋等人都属贵宾之列。据了解，该发廊每年大概有百万收入。
2008年，对于北京奥运会歌曲演唱的歌手，在广大的网友心目中似乎王菲是最佳人选。可见婚后王菲虽为了家庭生活在事业上暂时处于隐退状态，但是天后地位一直无人撼动。而这一年王菲似乎全身心的投入到慈善事业，在512四川八级地震后，身先士卒响应多项赈灾活动，出钱出力，自从公开献唱后，每次出席公开活动都被问及会否复出的问题，明显看出她的态度并没有像以往一样坚决，大多数时候只是笑而不答，没承认亦不否认。似乎暗示复出将至！
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