这期间还发生了一个小插曲，侯君集向太子表忠心后，回到家中常常坐立不安，生怕秘密泄露，他的妻子曾经觉察到这一点，让他有事瞒着最好禀报皇上，到时候还能换的不死，侯君集想我都干了一半，你叫我去自首，到时候不是照样杀头。结果，太子还没来得及发兵，就泄露了。
不仅自己与皇权断绝关系，连累侯君集被斩首，而这告密的人正是侯君集的女婿，所以说放人之心不可失啊。这还要追溯到侯君集大下高昌后，他私自藏了高昌国的国宝，还下令手下可以随意抢夺城中财富。这事传到朝廷上，文武百官对此偏见很大，认为有损大唐形象，李世民念及功劳大，没有过重的处罚。
但是侯君集认为自己战功显赫，却因为一点小错误败坏了名声，心中不平衡，这时太子李承乾因为担心自己被废除，然后知道侯君集心里有怨恨，就找人请侯君集出主意。这正和侯君集之意。但是谋反的事情败露，有人暗中告密，唐太宗这次确定了侯君集的谋反之意。
但还是认为罪不当死，想要对他网开一面，但是群臣认为要用国法处置这个危害国家存在的家伙，难道他把陛下您的恩情全忘了吗，是谁让他有现在的高官厚禄，是谁重用他这个斗大的字不识一个的家伙的。唐太宗没办法否决群臣的意见，唐太宗只能决定与侯君集诀别。
李世民亲自审问，说侯君集对国家有功劳，我不忍心让他死，因为他和我一起为大唐而奋斗，可以说你们之所以有今天的辉煌，很大程度上要依赖侯君集在前线的作战。但是无奈大臣都认为应该处死侯君集。唐太宗说看来我以后只能看着侯公的遗像来追忆我们的过去了，含泪下令杀了侯君集，侯君集上刑场的时候，面不改色。
对刽子手说，我是想要造反吗？我和陛下打下的天下，要我去毁灭他吗，只是我运气不好。你帮我告诉陛下，请他念在我有功于朝廷，不要加害我的孩子和夫人。李世民听了，感慨万千，将他的妻子和儿子流放到五岭之外，免得受朝廷的干扰。
