好友沈玉兰见他可怜，将他引进宫中当了太监。相传李莲英没有净身干净，他以一手漂亮的梳头功夫得到慈禧太后的赏识。李莲英为人聪明，善解人意，对待其他人也比较和善，慈禧打破乾隆是对太监“不得超过四品，永为定例”的祖制，赏李莲英为二品。
多年来，慈禧对李莲英宠眷不衰，二人常在一起并坐听戏，凡是李莲英喜欢吃的东西慈禧多在膳食中为他留下来，俩人关系十分暧昧。两人发生性关系也是有可能的，太监安德海，受宠和李莲英差不多。另据野史记载，慈禧喜欢吃汤卧果，每天早晨派人去宫门口卖几枚这种果子，由金华饭馆的伙计派人送来。
金华饭馆的伙计有一个姓史的年轻伙计，人长得玉树临风，英俊潇洒。史某与李莲英混熟了，经常被李莲英带到宫里玩。有一天，慈禧突然发现旁边站这个俊美的少年，便问李莲英这是谁。当时李莲英十分害怕，因为带外人进宫，严禁违反宫禁，但又不敢撒谎，这得如实禀告。
慈禧没有对他生气，反而很高兴，甚至兴奋，于是将史某留在宫中“昼夜宣淫”，据传一年后生下光绪。慈禧不敢养在宫中，命醇亲王代为养育，接着将史某灭口。所以，淫乱的寡妇太后慈禧，偷偷地在宫中生了一男半女也是有可能的，也许光绪真的是慈禧的亲生儿子。
光绪帝是同治的弟弟，慈禧却为反立子不立弟的常规，同治死后立光绪为帝，原因或许是因为光绪帝是她的亲生儿子，后来把光绪囚禁在瀛台而不杀原因大概也是因为此吧。毕竟虎毒不食子嘛！当然这是野史，不足为凭，在这里只作参考罢了。
那么光绪又为何会称呼慈禧为亲爸爸呢？ 慈禧爬上了统治全国的政治宝座，在清末的同治、光绪年间，她的地位其实一直是高于皇上的，居于太上皇的位置。这一点有悖于常理。按理说，在中国古代封建历史上，只有皇帝的父亲才能享有。
